Puerto Ayora es el principal núcleo urbano de Santa Cruz y una parada habitual al final del crucero.
Permite combinar el viaje de buceo con una visita terrestre a las tierras altas y la reserva de tortugas gigantes.
Es también una base excelente para extensiones terrestres en Galápagos.
La visita más importante es la reserva de tortugas gigantes en las tierras altas de Santa Cruz.
Además, Puerto Ayora permite pasear junto al mar, visitar tiendas locales y disfrutar de una cena en tierra, la única comida no incluida del itinerario.
Puerto Ayora puede visitarse todo el año.
De diciembre a mayo el clima es más cálido y húmedo, con vegetación más verde.
De junio a noviembre el ambiente es más fresco y seco, ideal para combinar con la temporada de grandes pelágicos.
No hay meses desaconsejados, aunque conviene reservar extensiones con antelación.